GMP证书APOSTILLE公证的办理流程主要包括以下步骤：

准备材料：首先，您需要准备好GMP证书原件、企业营业执照副本、以及可能需要的其他相关证明文件。请确保这些文件的真实性和有效性。

提交申请：将这些材料提交给本国的公证机构进行公证。公证机构会对您的GMP证书的真实性和有效性进行核实，并在公证证书上加盖印章或标签。

海牙认证：公证完成后，您需要将公证后的GMP证书和相关材料提交给海牙成员国政府机构进行加签，完成海牙认证。这一步骤是对您的GMP证书在国际层面上的进一步认证。

需要注意的是，不同国家和地区的医疗器械监管要求和标准可能存在差异，因此在办理APOSTILLE公证前，建议您先了解目标市场的具体要求和标准，确保您的GMP证书符合相关要求。