香港公司申请产地证的具体流程如下：

一、确定申请的产地证类型

根据货物出口的目的国和贸易协定，确定需要申请的产地证类型，如一般原产地证（CO）、普惠制原产地证（Form A）、各类自由贸易协定下的特定产地证（如中国 - 东盟自由贸易区原产地证 Form E、中国 - 智利自由贸易协定原产地证 Form F 等）2。

基本资料：通常需要提供提单（Bill of Lading）、商业发票（Commercial Invoice）、装箱单（Packing List）。

其他可能需要的材料：

公司营业执照复印件。

报关单电子档（部分情况下可能需要）。

若申请特定的产地证，还可能需要提供产品的原材料来源证明、生产加工流程说明等，以证明货物符合相应的原产地规则。

对于经过香港转运的货物，可能需要额外申请香港中检公司签发的 “未再加工证明”。此时需要提供由中国大陆商检局签发的相关产地证正本，如 Form A、Form E、Form F 等，以及填写完整的未再加工证明申请书。

自行申请：

如果香港公司在香港有实际的办公场所和工作人员，且熟悉产地证申请流程，可以直接向香港相关的签证机构（如香港工业贸易署或其认可的机构）申请。需先在相关机构进行注册登记，获取申请账号和密码等，然后通过指定的在线系统或提交纸质文件的方式进行申请。例如，申请香港原产地证书，需按照香港工业贸易署的要求，在其规定的系统中填写证书申请信息，并上传相关资料的电子文件或提交纸质文件至指定地点。

若货物是从中国大陆出口，香港公司也可以委托中国大陆的代理公司进行申请。代理公司通常会要求香港公司提供上述相关资料，并协助填写申请表格等文件。代理公司再将申请提交给中国大陆的相关签证机构（如各地的海关或贸促会）办理产地证。

通过代理机构申请：香港公司也可以选择专业的代理机构来办理产地证。代理机构一般具有丰富的经验和专业知识，能够更高效地处理申请事宜。香港公司只需将相关资料提供给代理机构，并按照其要求支付一定的服务费用。

无论是自行申请还是通过代理机构申请，都需要填写准确、完整的申请表格。申请表格的内容通常包括出口商信息（香港公司的名称、地址、联系方式等）、生产商信息（若有）、货物描述（如名称、规格、型号、数量等）、运输信息（起运港、目的港、运输方式、船名航次等）、原产地标准等