申请香港中转确认书的流程如下：

准备必要材料，包括货物信息、运输工具信息、货主信息、目的地信息以及其他证明文件，如进出口许可证、合同、装箱单等。

前往中转货物的承运人处办理，或者登记成为贸易单一窗口用户，并通过贸易单一窗口电子平台向香港海关递交申请表格及提供所需证明文件。

申请者需于有关货物抵达香港前至少递交“中转易”申请表格及所需证明文件。

香港海关会根据运输方式及所需的处理方法计算收费，并向申请人发出缴费单或由申请人在网上付款。完成缴费后，香港海关会处理申请及提供监管服务（如适用），并在完成申请审批后签发确认书。

需要注意的是，申请中转确认书是需要缴费的，而且货主在申请时一定要提供准确的货物信息，并在货物出发前仔细核实确认，防止在运输过程中出现意外。同时，申请香港中转确认书需要遵守香港的“中转确认书申请指南”，并在申请时仔细阅读相关规定。

以上信息仅供参考，如果您还有疑问，建议咨询相关人士。