申请RCEP原产地证需要准备的文件主要包括：

进出口经营权资格批准证书复印件（或对外贸易经营者备案登记表复印件）。

营业执照复印件和组织机构代码证复印件。

原产地证注册登记表（一式二份）。

产品成本明细单。

产品所用的原辅料、零部件的进料发票复印件。

此外，根据不同的原产地证类型和申请方类型，可能需要提供不同的文件。例如，对于日本原产地证RCEP的申请，还需要提供日本公司营业执照复印件、银行资信证明、中国出口商的公司章程或合同、中国进口商的公司营业执照副本复印件、日本进口商的护照首页及在留卡复印件、出口方工厂的生产许可证和环保报告等文件。