申请中国-马尔代夫自贸协定的流程主要包括以下几个步骤：

一、了解政策规定

在申请之前，申请人或企业应首先了解中国-马尔代夫自贸协定的具体内容、政策规定及申请条件。这可以通过中国商务部、马尔代夫商务部等官方渠道获取相关信息，也可以咨询的国际贸易机构或律师，以获取更详细的指导和建议。

二、准备申请材料

根据自贸协定的要求，申请人或企业需要准备相关申请材料。这些材料通常包括公司基本情况、产品信息、出口合同等。具体来说，可能需要提供以下文件：

企业营业执照、进出口经营权证明等资质文件；

产品的相关证明文件，如产品说明书、生产记录、原材料来源证明等；

出口合同、发票、装箱单、提单等贸易单据。

三、提交申请

申请人或企业需在中国商务部或马尔代夫相关部门的guanfangwangzhan上提交申请。填写相关信息并上传所需材料。具体提交方式可能因地区或机构而异，建议提前咨询相关部门或机构以获取准确的提交方式。

四、审核与批准

提交申请后，相关部门将对申请材料进行审核。审核过程可能包括对申请人资质、产品信息等的核实。审核通过后，申请人将获得中国-马尔代夫自贸协定的批准文件。这一过程可能需要一定的时间，具体时间因地区和机构而异。