申请医保商会自由销售证书需要准备以下资料：

产品注册文件：这包括产品的相关证书和报告，如产品合规性测试报告、产品质量认证证书等。

生产企业相关文件：需要提供生产企业的营业执照、生产许可证以及生产质量管理体系认证等文件。

产品说明书和标签：需要提供产品的详细说明、成分列表、用法用量等信息。

销售授权文件：如果您是代理商，需要提供品牌方的授权文件或合作协议等。

申请表格：需要填写医保商会提供的申请表格，并确保提供的信息准确无误。

其他必要文件：可能还需要提供公司营业执照副本、组织机构代码证副本、税务登记证副本、法定代表人的身份证复印件等其他可能需要提交的证明材料。