商检通关单和一般货物报关单在国际贸易和进出口业务中扮演着不同的角色，它们之间的主要区别如下：

定义与功能：

商检通关单：是由国家授权的商品检验机构出具的证明文件，确认货物已经通过检验并符合相关标准和规定。这个文件对于保证商品质量、保护消费者权益以及维护国家经济安全具有重要作用。

一般货物报关单：是进出口货物收发货人、运输工具负责人或其代理人按照海关规定，办理货物、物品、运输工具进出境及相关海关事务的手续和步骤时所需提交的书面申报材料。它是海关监管、征税、统计以及开展查验、放行等工作的重要凭证。

签发机构：

商检通关单：由商品检验机构签发，如国家质量监督检验检疫总局或其下属的检验检疫局等，代表对进出口商品的质量和安全进行的检验和监管。

一般货物报关单：由海关签发，代表海关对进出口货物的监管和放行。

适用情况：

商检通关单：只有法检货物和其他必须检验检疫的货物才需要办理商检通关单。

一般货物报关单：是进出口货物都需要的单据，无论是法检货物还是非法检货物。

办理顺序：

在需要商检通关单的情况下，必须先取得商检通关单或换证凭条，然后才能报关，才会有报关单。

总的来说，商检通关单和一般货物报关单在定义、签发机构、适用情况和办理顺序等方面存在明显的区别。在国际贸易和进出口业务中，这两种单据各自扮演着不同的角色，共同完成货物的进出口流程。