补办的中澳证，即中国——澳大利亚自由贸易协定原产地证书，在补办后是可以正常使用的，其主要作用就是用来减免关税。但需要注意的是，补办的中澳证必须通过代理代办，自己办理的过期证书海关不接受。

此外，如果中澳证遗失或损毁，从签发日期起半年内，申领单位需要填制《补发、重发或更改CO 证书申请单》，申明重发理由，经贸促会审查同意后重发产地证。签证机构会在相关栏目中注明原发证书的作废信息。如果海关出具的中澳证丢失，补办流程可能更为复杂，可能需要登报声明，并向海关申请更改中澳原产地证。

总的来说，虽然补办的中澳证可以正常使用，但为了避免不必要的麻烦和损失，企业应尽早办理，并妥善保管好相关证书。同时，对于补办流程和要求，企业应提前了解并遵循相关规定，以确保补办过程的顺利进行。